แขวงทางหลวงปัตตานี มีอำนาจหน้าที่ควบคุม ดูแลการก่อสร้างทางหลวงให้มั่นคง แข็งแรง สวยงาม และบำรุงรักษาทางหลวงให้ทางหลวงคงสภาพเหมือนเมื่อตอนก่อสร้างเสร็จใหม่ๆ
มีสภาพสมบูรณ์ดีตลอดเวลา และควบคุมการใช้ทางหลวงให้เป็นไปโดยถูกต้องตามกฎหมายทางหลวง เพื่อความสะดวก และปลอดภัยแก่ผู้ใช้ทางหลวง ดังต่อไปนี้

1)   วางแผนเกี่ยวกับงานบำรุงรักษาทางหลวง งานอำนวยความปลอดภัยทางหลวง และงานก่อสร้างโครงการขนาดเล็ก

2)   สำรวจ ตรวจสอบและจัดทำแผนและข้อมูลเกี่ยวกับแหล่งวัสดุงานทางและสภาพสายทางเบื้องต้น

3)   ดำเนินการเกี่ยวกับงานบำรุงรักษาทางหลวง งานอำนวยความปลอดภัยทางหลวง และงานก่อสร้างโครงการขนาดเล็ก

4)  บำรุงรักษาเพื่อป้องกันเสีย ปรับแต่ง ซ่อมเบาเครื่องจักร ยานพาหนะ เครื่องมือเครื่องใช้ สำหรับงานก่อสร้างและงานบำรุงรักษาทางหลวงที่อยู่ในความรับผิดชอบ

5)   ดำเนินการเกี่ยวกับการมีส่วนร่วมของประชาชนในพื้นที่ที่มีโครงการก่อสร้างบูรณะและบำรุงรักษาทางหลวง

6)   ตรวจตรา ดูแล และบังคับใช้กฎหมายว่าด้วยทางหลวงตามที่ได้รับมอบหมาย

7)   ดำเนินการเกี่ยวกับการอนุญาตตามกฎหมายว่าด้วยทางหลวงตามที่ได้รับมอบหมาย

8)   ดำเนินการเกี่ยวกับด่านชั่งน้ำหนักยานพาหนะเคลื่อนที่

9)   สนับสนุนและปฏิบัติงานร่วมกับจังหวัดและหน่วยงานอื่น

10) ปฏิบัติงานร่วมกับหรือสนับสนุนการปฏิบัติงานของหน่วยงานอื่นที่เกี่ยวข้องหรือที่ได้รับมอบหมาย